Trời đổ mưa khá nặng và kéo dài khá lâu khiến một số khu vực trong thành phố ngập sâu như Minh Khai, Vĩnh Tuy, Định Công, Long Biên. Nước chưa có hiện tượng rút xuống đã tràn vào nhiều tòa chung cư khiến cho một số khu vực hầm để xe bị ngập úng khá nặng, nhiều xe ô tô ngập chìm trong nước. Bên cạnh đó, khu vực Minh Khai gần nhà máy dệt ngập sâu khiến cho nhiều phương tiện đã chết máy khi di chuyển qua khu vực này. Ở đoạn cầu Vĩnh Tuy có chỗ ngập cao đến gần một mét nước, đường Minh Khai nước cũng lên cao phải đến nửa mét. Ảnh hưởng lớn ở khu vực này là khu chung cư cao cấp Times City, nước tràn vào trong khiến cho nhiều hầm để xe ngập úng trong nước, nhiều phương tiện, đặc biệt khu để xe ô tô, nhiều xe hơi đã chết ngập.

Một số hình ảnh ngập úng khiến cho các phương tiện đã chết lịm trong nước được chia sẻ trên nhiều diễn đàn:

Theo Trung tâm Khí tượng Thủy văn Trung ương, do ảnh hưởng của vùng thấp tồn tại trên khu vực Nam đồng bằng Bắc Bộ và Thanh Hóa nên ở khu vực đồng bằng Bắc Bộ và tỉnh Thanh Hóa trong đêm và sáng sớm nay (22/9) đã có mưa vừa, mưa to đến rất to. Lượng mưa tính từ 19h tối 21/09 đến 1h sáng 22/09 phổ biến 10- 30mm, có nơi lớn hơn như: trung tâm Hà Nội (Quận Hoàn Kiếm) 115mm; Bắc Ninh 101mm; Thanh Hóa 35mm.

Hiện nay, một số vùng thấp vẫn đang tồn tại trên khu vực Nam đồng bằng Bắc Bộ và Thanh Hóa. Khu vực đồng bằng Bắc Bộ và tỉnh Thanh Hóa tiếp tục có mưa vừa, mưa to, có nơi mưa rất to và giông, lượng mưa phổ biến từ 40-70, có nơi trên 100mm.